戚继光会武功，其武术长拳学自祖辈，故称太祖长拳。至于戚继光的功夫如何，没有记载。

戚继光在福建召集了全中国之武术家与少林僧人研究出一套对抗日本海盗之拳法及棍法。以铁棍对浪人刀。他写的“纪效新书”内容包括兵法、拳术、箭法、兵器等使用方法。其中卷十四之《拳经捷要篇》所谈的是拳术，更附有戚继光自己改良自长拳之卅二势。戚离去后，留下之拳种及锻炼士兵的方法，再经历郑成功之洪门时期，最后发展成多个门派之南方武术。

戚继光在福建曾经整理当时全国武术时记载包括长拳，短打、红拳，巴子拳等，但当时未有提及少林派及武当派，而少林直到民国初期，人们才将之统称南少林拳。