电视剧中两人的结局不曾在一起。

结局为朱祁镇历尽艰难终于重归故土，允贤面临情感的两难选择，却发现朱祁钰早已被权力蒙蔽了心智。经历了人生坎坷波折的允贤从未放弃事业的追求。她在宫廷中开创了女医制度，又在民间设立医馆，广招学徒，既做到了悬壶济世，又从实际意义上提高了古代女性的地位。多年后，明朝政局稳定，朱祁镇主动离开权力中心，遍走江湖，只为寻找允贤共度此生。