通常来说菩提子上面的小洞是胚芽眼，由于菩提子是植物的果实或者种子，大部分的天然菩提子上面都会有一个小洞。而在制作手串的时候，主要以这个小洞作为中心的位置进行钻孔开皮。

由于菩提子是植物的果实或者种子，它上面很多的小洞其实是胚芽眼，而大部分的菩提子表面都会有小洞。在制作手串的时候，都会将这种小洞作为中间的圆孔，这种菩提也叫做正月，若是小洞不是中心的位置，则为偏月。

菩提子的品种丰富多样，其中星月菩提的表面上有很多的黑点，这些黑点是天然形成的，中间部分有一个凹陷的圆圈，看上去类似于众星捧月一样，所以星月菩提也是被誉为文玩界的四大名珠之一。

随着文玩市场的兴起，菩提子指的是可以用来制作佛珠或者文玩手串的植物果实，这种植物主要生长在热带的高原地区，由于各地气候和生长环境的不同，出产的菩提子品质也各不相同，其中市场中的优质菩提大多数是源于尼泊尔地区。