扇贝中有两种类型的肉，一种是扇贝的内敛肌，呈白色，很有肉感，另一种则是分布在内敛肌周围的肉，红色且很柔软。通常，扇贝中的肉只取内敛肌作为食材，而周围红色的肉则被丢弃。

在食用扇贝时只吃扇贝中呈圆形的贝柱部分，不要吃内脏。扇贝本身是安全的水产品，扇贝是滤食性生物，靠吸收海水中的藻类和微生物生长，若其生长环境污染或有毒藻类暴发，其内脏就会摄入这些物质。海产贝类含有毒素或重金属一般与“赤潮”和“海水受污染”有关。

扇贝可以食用的部位是开启贝壳的壳内肌和生殖腺，大大的壳内肌为白色，味道鲜美可口。生殖腺部位的肉稍微呈片状，每当春末生殖腺成熟的时候，雌性扇贝的生殖腺变为漂亮的红色，而雄性扇贝的生殖腺则变成乳白色。