程序文件是在质量管理体系中质量手册的下一级文件层次，规定某项工作的一般过程。

再下一级文件层次是作业指导书。程序文件存储的是程序，包括源程序和可执行程序。这里的程序与计算机技术中的程序并不相同，程序在这里指是为完成某项活动所规定的方法。