食品污染按污染源的性质：生物性污染、化学性污染、放射性污染 。

生物性污染：食品的生物性污染包括微生物、寄生虫和昆虫的污染、有毒生物组织污染 、昆虫污染，主要以微生物污染为主，危害较大，主要为细菌和细菌毒素、霉菌和霉菌毒素。

化学性污染：来自生产、生活和环境中的污染物，如农药、有害金属、多环芳烃化合物、二恶英等；从生产加工、运输、储存和销售工具、容器、包装材料及涂料等溶入食品中的原料材质、单体及助剂等物质；在食品加工储存中产生的物质，如酒类中有害的醇类、醛类等；滥用食品添加剂