没有区别。司令员就是司令，是我国各军、兵种流传下来的一种特殊称呼。指某部队的最高军事指挥官，司令员是规范的称呼，司令是口语，不规范，特别是在行文或著书时不应使用“司令”。这种称谓沿用到今天，就是“司令员”这一称谓的来历，因此以上也都说“司令员”是正式的职务名称和称谓，因为这是自红军以来解放军各种条令中的正式称呼。