原来二本的分数线会提高，而原来一本的分数线则会降低，等到一本二本合并后的第二年，则高考分数线变化不大。录取最低控制分数线由各省、自治区、直辖市分别划定。

本科批次合并招生，对考生最大的影响就是增加了报考志愿的难度。以前，一批、二批、三批有明显的录取分数线，考生可以根据自己的成绩和高考录取分数线，再参照高考志愿填报一书，很容易确定自己应该报考一本院校，还是二本院校。但是，本科批次合并后，只有一个本科控制线，没有了一本线和考生自身高考成绩与一本线的线差，报考志愿变得无据可依了。

一本二本合并后，新划定的一本最低分数线，其实和之前的二本分数线是差不多的，所以合并后一本分数线是会下降的，不过对于本来二本线考生来说关系不是很明显，但是本来一本线左右的考生，要注意合并后所谓的一本线的变化。