九江学院的药学专业，培养具备坚实、宽厚的化学、生物学基本理论知识，并且能系统地掌握药学学科的基础理论、基本知识和基本技能，具备药品研发、药物制剂设计与制备、药物分析与检验的初步能力，从事药物研发、生产、质量监控和管理的高级药学专门人才。

九江学院的药学专业的主干学科为化学和药学，开设课程除一些综合教育和文理基础课程外，主要有分析化学、物理化学、药物化学、药理学、药剂学、药物分析学、药事管理学等必修课程和药品质量控制、中药研究与新药开发、药物毒理学等选修课程。